در این آزمایشگاه پروژه های تحقیقاتی و پایان نامه تحصیلی دوره عمومی داروسازی در زمینه سنتز ترکیبات داروئی جدید و یا قبلاً ساخته شده، قابل انجام است. وسعت این آزمایشگاه 120 متر و دارای تجهیزاتی از قبیل هیتراستیرر،کابینت UV ،پمپ خلاء، آب مقطر گیری، شوف بالن، آون، تبخیرکننده های گردان (Rotary evaporator) ، سیستم خشک کن حلال و انواع لوازم شیشه ای مورد نیاز می باشد.
فعالیت آموزشی این بخش شامل تربیت دانشجو، گذراندن دوره های کارآموزی، کارگاه های آموزشی و انجام تحقیقات به صورت عملی می باشد که نتایج تحقیقات به صورت مقاله در مجلات معتبر خارجی و داخلی قابل چاپ است.
تعدادی از دستگاههای موجود در این آزمایشگاه به شرح ذیل می باشد:
دستگاه روتاری دستگاه تقطیر استون
حمام اولتراسونیک کابینت UV
پمپ خلاء دستگاه آب مقطر گیری
ترازو هیتر استیرر
دستگاه دی آیوناز (آب خاص ساز) ستون کروماتوگرافی
کپسول آرگون دستگاه یخ ساز
دستگاه حمام آب گرم